Sadržaj
Peptidi su fragmenti kratkih polimera sastavljeni od aminokiselina. Svaki peptid ima određeni slijed aminokiselina označen s troslovnim kodom ili samo jednim; na primjer, aminokiselina alanin je skraćeno kao "Ala" ili "A". Opterećenje peptida u otopini ovisi o njegovoj kiselosti. Izoelektrična točka (pI) odnosi se na vrijednost kiselosti otopine u kojoj molekula peptida ima neto naboj jednak nuli. Topljivost peptida je na izoelektričnoj točki minimalna. Upotrijebite dostupne web poslužitelje za izračun vrijednosti pI za aminokiselinski slijed peptida.
Korak 1
Slijedite peptid pomoću jednoslovnog koda. Na primjer, ako peptid ima Ala-Ser-Glu-Leu-Pro aminokiselinsku sekvencu (Alanin - Serin - Glutaminska kiselina - Leucin - Prolin), tada bi jednoslovni slijed bio "ASELP". Ako je potrebno, pogledajte tablicu pretvorbe od jednog slova do tri slova koja se nalazi u odjeljku Resursi.
Korak 2
Upotrijebite bilo koji preglednik, poput Internet Explorera ili Firefoxa, za ulazak na poslužitelj koji izračunava izoelektričnu točku peptida (pI); vidi Resursi.
3. korak
Upišite jednoslovni slijed peptida - u našem primjeru "ASELP" - u okvir i kliknite "Compute".
4. korak
Očitajte vrijednost izoelektrične točke (pI) zadane u retku "Teoretski pI / Mw" (teoretski pl). U našem primjeru, pI je 4,00. Imajte na umu da poslužitelj također izračunava molekularnu težinu (Mw) peptida.